撰文丨王聪

剪辑丨王多鱼

排版丨水成文

泛基因组（Pangenome）正在透澈改革咱们解析具有复杂变异的基因组区域的才略。但是，现存的东说念主类泛基因组由于样本量小，关于医学和群体遗传学诈欺的遵守有限。

2026 年 4 月 1 日，西湖大学杨剑老师团队（博士扣问生王逸飞、助理扣问员段忠取博士为论文共同第一作家）合股温州医科大学沈贤老师，在国际顶尖学术期刊Nature上发表了题为：The 1000 Chinese Pangenome empowers medical and population genetics 的扣问论文。

扣问团队改进性地开拓了基于泛基因组的合股拼装（PIGA）步伐，告捷构建了千东说念主泛基因组（1000 Chinese Pangenome，1KCP），极大突破了既往泛基因组样本量的上限，这亦然迄今摒弃范畴最大、最全面的东说念主类泛基因组资源库，从中发现了4.053 亿个碱基对的全新序列，这些占据东说念主类基因组13%的序列所昔时从未被纪录过的“基因新大陆”，且其中2620 万个碱基对具有明确的功能，触及基因编码区和调控元件。

这项扣问提高了咱们对复杂遗传变异止境功能的领悟，为东说念主类健康扣问和疾病精确会诊提供了坚实的基础。

什么是“泛基因组”？

如若把每个东说念主的基因组比作一册由 30 亿个字母（碱基对）写成的生命之书，那么传统的东说念主类参考基因组就像是这本书的“轨范版”。但问题是，这个“轨范版”主要基于欧洲白东说念主的基因组数据构建，无法都备代表群众不同东说念主群的遗传各种性。

泛基因组（Pangenome）则不同——它不是单一版块，而是一个群体中总共基因组序列的聚会，包含了该群体中存在的总共遗传变异，泛基因组巧合更全面地响应东说念主类基因组的真的式样。

为什么需要中国东说念主群的泛基因组？

遥远以来，东说念主类基因组扣问严重依赖基于欧洲东说念主群的参考基因组。即即是最新的“东说念主类泛基因组参考定约（HPRC）”名目，在其汇集的群众 46 个样本中也仅包含 3 个中国东说念主样本，无法代表 14 亿中国东说念主的遗传各种性。

这种依赖导致了一个严重问题：东亚东说念主群独到的残暴遗传变特地常被遗漏或误判，径直影响疾病会诊的准确性和药物研发的针对性。

中国领有天下上最丰富的东说念主群遗传各种性——从西南高原的藏缅语宗族群，到西北丝绸之路的多元合并，从云贵地区的苗瑶语族，到朔方草原的蒙古语族……这种各种性是结实东说念主类演化、疾病易理性和药物反应各异的淡雅资源。

这项扣问的新发现

1、范畴空前：1116 个高质料基因组

扣问团队构建了1116个中国东说念主群的二倍体基因组拼装，其中包括 55 个从新拼装和 1061 个基于泛基因组教唆的拼装。这是当今群众最大范畴的中国东说念主群基因组资源库。

2、发现“新大陆”：4 亿个新序列

比较现存的国际参考基因组（GRCh38 和 CHM13），1KCP 泛基因组中发现了4.053 亿个碱基对的全新序列，这些占据东说念主类基因组13%的序列所昔时从未被纪录过的“基因新大陆”。更令东说念主奋斗的是，其中 2620 万个碱基对具有明确的功能，触及基因编码区和调控元件。这意味着咱们发现了大量可能影响中国东说念主健康和疾病的新遗传元件。

3、全面解析遗传变异“全家福”

该扣问系统淘气了 3540 万个小变异、11 万多个结构变异、48.5 万个串联重迭序列，以及 86 万个“嵌套变异”（荫藏在复杂结构变异中的次级变异）。止境值得关怀的是，33.3% 的结构变异是初度被发现，其中 83.5% 属于残暴变异（在东说念主群中频率 ≤1%）。这些残暴变特地常与遗传性疾病密切关连，但在小样本扣问中极易被遗漏。

4、医学诈欺的径直笔据

扣问团队深切分析了这些变异与疾病的关系：

基因结构变异：发现了 5239 个径直影响卵白质编码基因外显子的结构变异，平均每个中国东说念主佩带 450 个这么的变异，其中 9 个是残暴变异。

串联重迭扩增：淘气出 2427 个串联重迭扩增事件，这些与多种神经退行性疾病（举例亨廷顿病、小脑性共济失调等）密切关连。

基因簇各种性：发现了 735 个存在结构变异的基因簇，这些基因簇在血液和免疫关连功能中显耀富集，响应了东说念主类适应不同病原体的进化历程。

基于泛基因组的合股拼装经由

从“跟跑”到“领跑”的历史性跳跃

20 年前，中国在东说念主类基因组接头中只承担了 1% 的测序任务。今天，中国科学家 100% 孤独完成了这项里程碑扣问。

这项后果不仅冲破了 20 年来东说念主类泛基因组边界国际的“把持”地位，更终赫然我国在该边界从“跟跑”到“并跑”，致使“领跑”的滚动。

1KCP 项观点道理远不啻于发表学术论文：

1、填补精确医学空缺：为中国东说念主群的疾病风险磋商、药物基因组学和个性化调理提供了专属的遗传参考框架。

2、提高会诊准确性：残暴遗传病的会诊将愈加精确，幸免因参考基因组不匹配导致的误诊漏诊。

3、加快新药研发：基于中国东说念主群特异的遗传变异，不错开拓更合乎中国东说念主的靶向药物。

4、洞开数据平台：扣问团队建树了 1KCP 数据派系，鼓吹关连扣问的发展。

论文合股：

https://www.nature.com/articles/s41586-026-10315-y